Les personnes remarquent souvent une thrombophilie due à une résistance à la protéine C activée (APC) lorsqu’une thrombose veineuse profonde survient — gonflement soudain de la jambe, douleur, chaleur et rougeur — ou lorsqu’une embolie pulmonaire provoque une douleur thoracique aiguë, un essoufflement ou des palpitations (rythme cardiaque rapide). Elle peut aussi être mise en évidence après un événement thrombotique inhabituel survenant à un jeune âge, un caillot pendant la grossesse ou sous contraception contenant des œstrogènes, ou lorsque plusieurs membres de la famille ont présenté des caillots sanguins. Chez beaucoup de personnes, il n’y a aucun signe d’alerte avant la réalisation d’examens après un caillot ; ainsi, les « premiers signes de thrombophilie due à une résistance à l’APC » sont souvent les symptômes du caillot lui-même.